Rakovina: Tieto 4 gény pomáhajú predpovedať výsledok
Rozsiahly výskum úlohy supresora nádoru p53 ponúka lepšie pochopenie genetických mutácií, ktoré sa vyskytujú pri rôznych formách rakoviny, ako aj identifikáciu štyroch génov, ktoré môžu pomôcť predpovedať vyhliadky človeka.
The TP53 Gen je zodpovedný za kódovanie toho, čo vedci nazývajú tumorový proteín p53 - tumor supresor, ktorý dokáže zabrániť bunkám v rýchlom delení a množení.
Vedci dabovali TP53 „strážcu genómu“ kvôli svojej rozhodujúcej úlohe pri prevencii nádorov a udržiavaní bunkového delenia na uzde.
Ľudské rakoviny často obsahujú mutácie v TP53 gén, ktorý spôsobil zlyhanie jedného z kritických obranných mechanizmov proti rakovine.
Prvé štúdie, ktoré identifikovali TP53 mutácie v rakovine človeka sa objavili v 80. rokoch a odvtedy vedci venovali veľa času a zdrojov objasneniu svojej úlohy pri rakovine.
V súčasnosti najväčšia štúdia tohto druhu využíva vzorky nádorov od viac ako 10 000 pacientov s rakovinou a zameriava sa na 32 rôznych typov rakoviny, aby lepšie pochopila úlohu TP53.
Dr Larry Donehower, profesor molekulárnej virológie a mikrobiológie na Baylor College of Medicine v Houstone, TX, viedol nový výskum, ktorý sa objavuje v časopise Správy buniek.
Gény Telltale 4 môžu pomôcť predpovedať výhľad
Dr. Donehower a tím použili päť rôznych dátových platforiem na extrahovanie 10 225 vzoriek z 32 druhov rakoviny. Pomocou Canlas Genome Atlas (TCGA) boli vedci schopní komplexne zhodnotiť úlohu dráhy p53 u týchto 32 druhov rakoviny.
Dr. Donehower a kolegovia potom porovnali údaje TCGA s ďalšou databázou 80 000 genetických mutácií, ktoré Dr. Thierry Soussi, profesor molekulárnej biológie na univerzite Sorbonne v Paríži vo Francúzsku, zhromaždil počas 30 rokov.
Vedci to zistili TP53 mutácie sa vyskytovali častejšie u ľudí, ktorí mali horší výhľad. Analýza ďalej zistila, že „Viac ako 91% prípadov rakoviny s TP53 mutácie ukazujú stratu oboch funkčných TP53 alely, “alebo varianty génov.
Dr. Donehower vysvetľuje: „V niektorých rakovinových génoch uvidíte jednu kópiu dvoch génov stratených alebo zmutovaných,“ ale „viac ako 91 percent všetkých druhov rakoviny stráca obidve TP53 gény, nielen jeden. “
K druhej strate alely, píšu autori, došlo „mutáciou, chromozomálnou deléciou alebo kópiou neutrálnou stratou heterozygozity“ - teda duplikáciou génov. Vedúci výskumný pracovník tiež poznamenáva, že tento posledný proces sa vyskytoval oveľa častejšie, ako sa doteraz domnievali.
Je dôležité, že výskum tiež identifikoval štyri gény, ktoré vykazovali nadmernú expresiu u mutantov TP53 nádory. Podľa vedcov môžu tieto štyri gény „povedať“, či má pacient s rakovinou dobrý výhľad alebo nie.
"Ak máte vysokú expresiu týchto štyroch génov, máte pacienta, u ktorého je pravdepodobnosť zlej prognózy vyššia [...] Naopak, ak má tento pacient veľmi nízku expresiu týchto génov, pravdepodobne prežije dlhšie a bude mať dobrá prognóza. “
Dr. Larry Donehower
"Poskytne ti lepšiu predstavu o tom, ako sa mu bude dariť, než len vedieť, či je pre neho mutant." TP53 alebo nie, “pokračuje doktor Donehower.
A konečne, štúdia silne spojená TP53 mutácie s genómovou nestabilitou, čo je nález, ktorý je v súlade s TP53Typická úloha „strážcu genómu“.
Dr. Donehower komentuje jedinečnosť nového výskumu slovami: „Väčšina štúdií o TP53 zamerať sa na jeden typ rakoviny. “
"Pri pohľade na 32 rôznych typov rakoviny vidíte, že určité vzorce vydržia bez ohľadu na typ rakoviny."
Spoluautor štúdie a riaditeľ Cancer Genomics na Baylor College of Medicine, Dr. David Wheeler, tiež komentuje význam zistení.
Hovorí: „Odvtedy TP53 je jedným z najdôležitejších strážcov v prevencii rakoviny, čím lepšie porozumieme tomuto génu, tým lepšie porozumieme základnej biológii rakoviny. To povedie k lepším terapiám. “
